2006/04/01 by Meredith Stewart, Ross Perry, Shane Raidal · 1 citation
Agricultural and Biological Sciences · Biochemistry, Genetics and Molecular Biology · Medicine · #Animal Virus Infections Studies #Virus-based gene therapy research #Viral gastroenteritis research and epidemiology #Circovirus #Biology #Porcine circovirus #Virology #Feather #Genetics #Capsid #Virus #Sequence analysis #Genome #Gene #Zoology
paper · doi:10.1080/03079450600597345
openalex publication_date 2006/04/01 · openalex created_date 2016/06/24 · openalex updated_date 2026/07/29
The complete genome of a novel Circovirus isolated from an Australian raven (Corvus coronoides) with feather lesions similar to those that occur in psittacine beak and feather disease is reported. Degenerate polymerase chain reaction primers were designed to amplify and sequence novel Circovirus DNA from affected feathers. Sequence analysis indicated that the tentatively named raven circovirus (RaCV) was 1898 nucleotides in size with two major open reading frames synonymous with other avian circoviruses, ORF C1 and ORF V1, likely to encode a putative capsid protein (Cap) and replicase-associated protein (Rep), respectively. In common with other circoviruses was the conservation of several nucleotide structures and amino acid motifs implicated in virus replication. Comparison with other members of the Circoviridae demonstrated that RaCV shares the greatest sequence homology with canary circovirus (CaCV) and pigeon circovirus (PiCV) and was more distantly related to the beak and feather disease virus, goose circovirus, duck circovirus and the two porcine circoviruses, PCV1 and PCV2. Phylogenetic analysis of the genome and the putative Cap and Rep proteins provided further evidence of the close relationship of RaCV with CaCV and PiCV. Identification d'un nouveau circovirus chez les corbeaux d'Australie (Corvus coronoides) avec une maladie des plumes Le génome complet d'un nouveau circovirus isolé d'un corbeau australien (Corvus coronoides) qui présentent des lésions des plumes similaires à celles observées dans la maladie du bec et des plumes des psittacidés est présenté. Les amorces dégénérées de la PCR ont été sélectionnées pour amplifier et séquencer l'ADN du nouveau circovirus à partir des plumes affectées. L'analyse de la séquence a montré que le circovirus, nommé provisoirement circovirus du corbeau (RaCV), avait 1898 nucléotides avec deux principaux cadres ouverts de lecture synonymes des autres circovirus aviaires, ORF C1 et ORF V1 qui respectivement étaient supposés coder une protéine de capside putative (Cap) et une protéine associée à la réplicase (Rep). La conservation de plusieurs structures nucléotidiques et de motifs d'acides aminés impliqués dans la réplication virale sont des caractéristiques communes avec les autres circovirus. La comparaison aux autres membres des Circoviridae a montré que le RaCV présentait la plus grande homologie de séquence avec le circovirus du canari (CaCV) et le circovirus du pigeon (PiCV) et était plus éloigné du virus de la maladie du bec et des plumes (BFDV), du circovirus de l'oie, du circovirus du canard et des deux circovirus porcins PCV1 et PCV2. L'analyse phylogénétique du génome, des protéines Rep et Cap putative ont fourni des preuves complémentaires de la relation étroite du RaV avec le CaCV et le PiCV. Identifizierung eines neuen Circovirus in australischen Krähen (Corvus coronoides) mit Befiederungsstörungen Es wird über das komplette Genom eines neuen Circovirus, das aus einer australischen Krähe (Corvus coronoides) mit Federveränderungen ähnlich denen bei der psittazinen Schnabel-und Federkrankheit (PBFD) isoliert worden ist, berichtet. Zur Amplifizierung und Sequenzierung der neuen Circovirus-DNS aus den betroffenen Federn wurden degenerierte PCR-Primer entwickelt. Die Sequenzanalyse zeigte, dass das vorläufig als Krähencircovirus (RaCV) bezeichnete Virus eine Größe von 1898 Nukleotiden hatte. Es wies wie bei den anderen aviären Circoviren zwei bedeutende offene Leserahmen auf, ORF C1 und ORF V1, die wahrscheinlich für das Kapsidprotein (Cap) bzw. für das Replikase assoziierte Protein kodieren. In Übereinstimmung mit anderen Circoviren war auch die Konservierung von mehreren Nukleotidstrukturen und Aminosäurenmustern, die mit der Virusvermehrung im Zusammenhang stehen. Der Vergleich mit anderen Mitgliedern der Familie der Circoviridae ließ erkennen, das das RaCV die größte Sequenzhomologie mit dem Kanariencircovirus (CaCV) und dem Taubencircovirus (PiCV) teilte und nur entferntere Beziehung zum BFDV, dem Gänse-, Enten- und zwei Schweinecircoviren (PCV1 unf PCV2) aufwies. Die phylogenetische Analyse des Genoms sowie der mutmaßlichen Cap- und Rep-Proteine erbrachten weitere Hinweise auf die enge Verwandtschaft des RaCV mit dem CaCV und PiCV. Identificación de un nuevo circovirus en cuervos Australianos (Corvus coronoides) con la enfermedad de la pluma Se describe el genoma completo de un nuevo Circovirus aislado a partir de cuervos Australianos (Corvus coronoides) con lesiones en las plumas similares a aquellas encontradas en la enfermedad del pico y las plumas de las psitácidas. Se diseñaron cebadores de PCR degenerados para amplificar y secuenciar el DNA del nuevo Circovirus a partir de las plumas afectadas. Los análisis de las secuencias indicaron que el circovirus llamado provisionalmente circovirus del cuervo (RaCV) tenía un tamaño de 1898 nucleótidos con dos marcos principales de lectura abierta al igual que otros circovirus aviares, ORF C1 y ORF V1, que probablemente codifiquen una supuesta proteína de la cápside (Cap) y una proteína asociada a la replicasa (Rep), respectivamente. La conservación de diversas estructuras nucleotídicas y motivos aminoacídicos implicados en la replicación vírica fueron comunes a otros circovirus. La comparación con otros miembros de Circoviridae demostró que RaCV compartía la mayor homología de secuencia con el circovirus del canario (CaCv) y el circovirus de la paloma (PiCV) y estaba relacionado de manera más distante con el virus de la enfermedad del pico y las plumas (BFDV), el circovirus del ganso, el circovirus del pato y los dos circovirus porcinos, PCV1 y PCV2. El análisis filogenético del genoma y de las supuestas proteínas Cap and rep proporcionaron más evidencias de la estrecha relación de RaCV con CaCv y PiCV.